การตรวจสุขภาพคนงาน เพื่อให้เกิดการคัดกรองสุขภาพคนงานที่มีประสิทธิภาพจะต้องคำนึงการควบคุมคุณภาพการตรวจสุขภาพ นับตั้งแต่ การจัดรายการตรวจสุขภาพที่เหมาะสมกับกลุ่มเสี่ยงโรค การเลือกใช้หน่วยตรวจสุขภาพที่มีบุคลากรที่มีความรู้ทางด้านโรคเนื่องจากการทำงาน ได้แก่ แพทย์อาชีวเวชศาสตร์ พยาบาลอาชีวอนามัย และนักเทคนิคการแพทย์ที่ทำหน้าที่เก็บตัวอย่างเลือด ปัสสาวะ ด้วยความชำนาญและนำไปวิเคราะห์ด้วยเครื่องที่มีความแม่นยำสูง มีการควบคุมคุณภาพของเครื่องมือและอุปกรณ์ เป็นต้น และการเตรียมตัวของลูกจ้างที่จะเข้ารับการตรวจสุขภาพ ในที่นี้จะกล่าวถึงการควบคุมคุณภาพการตรวจ 2 ประการ คือ
การเตรียมตัวของลูกจ้างเพื่อการตรวจสุขภาพ
การตรวจร่างกายทั่วไป
การตรวจเลือด
การตรวจปัสสาวะ
การตรวจสมรรถภาพปอด
การตรวจสมรรถภาพการได้ยิน
การตรวจสมรรถภาพการมองเห็น
การตรวจหาปริมาณสารเคมีในร่างกาย
แนวทางการเลือกใช้หน่วยบริการตรวจสุขภาพ